10、安室透
本名降谷零，警察潛伏在黑暗組織的臥底，組織代號波本，精通格鬥技，車技一流，頭腦也很好，還會做飯，玩音樂真可謂是全才。
9、貝爾摩德
貝姐真可謂柯南裡的顏值擔當，天使的臉龐外加魔鬼的身材，雖然是黑暗組織的成員但是十分的重視承諾，為了承諾隱瞞了柯南與灰原的真實身份，經常單獨行動，被稱為「神秘主義者」。早年與工藤有希子在黑羽盜一門下學習易容，成為朋友。
8、世良真純
自稱為偵探的女高中生，是赤井秀一和羽田秀吉的妹妹。轉學至帝丹高中2年B班，成為小蘭和園子的同班同學。擅長截拳道，推理能力出眾。經常做中性打扮，平胸。因十年前與新一見過知曉柯南真實身份。
7、赤井秀一
FBI搜查官，喜歡戴一個針織帽，真可謂神一般的存在，槍法在柯南所有人物裡絕對的第一，會使用截拳道，實力據世良的描述是世良的三倍，車技也很好，曾經以諸星大的身份打入組織內部榮獲黑麥威士忌的名號，被組織成為「銀色子彈」
6、服部平次
關西的高中生名偵探，和工藤新一並稱「關東的工藤，關西的服部」。是第一個通過推理得知柯南身份的人，雖然個性有點魯莽，但卻是一個重情重義的人。
5、怪盜基德（二代）
本名黑羽快鬥，在柯南的世界中屬於客串的角色，真正的基德的故事可以去看《魔術快鬥》，基德頭腦聰明，行動能力極強，精通易容術，變聲，逃脫，被譽為「月光下的魔術師」
4、江戶川柯南
本作主人公，所以柯南不用多做介紹，柯南的名字來源一個是日本的推理小說家江戶川亂步，另一個則是
《福爾摩斯》的作者柯南·道爾，柯南生日5月4日，是福爾摩斯和莫裡亞蒂教授一同墜入瀑布的日期。
3、工藤新一
工藤新一是柯南的真正身份，柯南服下ATPX4869前的身份，平成年代的福爾摩斯。
2、毛利蘭
本作女主角，工藤新一青梅竹馬的女朋友，就讀於帝丹高中2年B班，是學校空手道部的主將，市裡的空手道冠軍，一直默默的等待著工藤新一的出現，再次期間也曾懷疑過柯南的身份，不過都被柯南隱瞞過去。
1、灰原哀
本名宮野志保，與柯南一樣是服用了ATPX4869之後身體縮小，也是該藥品的發明者，灰原可謂博學多才，精通於日語，英語，西班牙語，在數學，物理，生物，計算機，醫學各方面都有所了解。
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