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《瑪娜莉亞魔法學院》是Cygames旗下社交遊戲《巴哈姆特之怒》內的活動，於2015年8月決定動畫化。2016年4月宣布跳票到2019年1月播出。10月26日本作追加了三位角色的設定圖，中博史也作為追加聲優出場。
本次追加的三位角色設定圖是：威廉（CV：內田雄馬）、海茵萊茵（CV：澤城千春）、吉爾（CV：中博史）。《瑪娜莉亞魔法學院》和此前的《巴哈姆特之怒》系列動畫除世界觀相同外沒有什麼聯繫，所以並不是其續作，而是更符合遊戲的正統劇情。動畫由岡本英樹擔任監督，關根聰子負責系列構成，吉田南負責角色設計，渡邊崇負責音樂，CygamesPictures負責動畫製作。