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近期在Nucleic acids research上發表的文獻中介紹了一種癌症細胞功能相關的單細胞測序數據庫。該數據庫旨在為癌症異質性研究提供可視化的數據支持。
該項研究結果發表於 Nucleic acids research
文獻重點介紹了數據庫的數據收集和處理流程以及用戶界面功能。用戶既可以通過特定基因研究相關細胞功能或從細胞功能開始研究相關基因，也可以總覽和下載數據庫中收錄的所有原始數據。
數據庫的數據收集和處理流程以及用戶界面功能示意圖
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從細胞功能到基因
進入官網主頁後點擊特定功能，如metastasis，可以查詢不同癌症單細胞測序研究中和細胞轉移相關的基因，並追溯數據的來源:
（註* 官網網址：http://biocc.hrbmu.edu.cn/CancerSEA/ ）
數據庫主頁
多種癌種中所有和轉移相關的單細胞測序數據結果
此外數據庫還能顯示和細胞轉移相關的所有PCG（protein-coding genes）和lncRNA結果並關聯GO和KEGG的信號通路分析結果：
癌細胞功能相關PCG、lncRNA和信號通路
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從基因發掘相關細胞功能
該數據庫支持單個基因、癌種和功能、基因集三種搜尋方式，提供了豐富的數據檢索方式：
網站搜尋界面
搜尋結果會匹配關鍵詞與不同癌種、不同細胞功能的相關性，給出可視化的點狀圖：
相關性匹配結果
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數據總覽
所有收錄的數據均可溯源並瀏覽下載原始數據，亦可在線瀏覽包含PCG、lncRNA、拷貝數突變等可視化數據：
總覽頁面下包含所有收錄數據的導航
基於PCG、lncRNA表達、基因拷貝數突變的可視化圖表
單細胞測序技術將有力推動癌症異質性研究。可預見未來中海量相關數據湧現的趨勢下，高度可視化和頻繁更新的數據庫會是研究者非常可靠的工具。
參考文獻：
Yuan H et al, CancerSEA: a cancer single-cell state atlas, Nucleic Acids Re (2018).
Doi:10.1093/nar/gky939
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