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文章目錄[ 隱藏 ]
- 數據來源
- 病例定義
- 實驗室檢測
- 去年12月已經人傳人
- 平均1個病人會傳染給2.2個人
- 疾病發現早,難隔離
- 醫療工作者沒非典那麼慘,兒童可能不易感
十三 郭一璞 發自 自我隔離中
量子位 報導 | 公眾號 QbitAI
不管疫情,忙著發論文?
1月29日,中國疾控中心(CDC)在《新英格蘭醫學雜誌》發了一篇名為《新型冠狀病毒感染的肺炎在中國武漢的初期傳播動力學》的論文。
這份期刊2018年的影響因子是70.670,可以說是醫學期刊最高峰,碾壓影響因子59.102的《柳葉刀》。
不過,論文一發表,CDC就被各界聲討,不少人覺得它們早就發現了問題,不忙著控制疾病先發論文給自己的簡歷貼金。
到了今天早上,被輿論追到風口浪尖的中國疾控中心(CDC)回應了。
CDC說,論文里的數據分析一出來,還沒寫論文,就已經向社會公布了,而「12月就人傳人」這個判斷,是基於後來的數據和資料反推回去的。
換句話說,CDC說並沒有向社會隱瞞疫情。
回應全文如下:
中國疾病預防控制中心關於在新英格蘭醫學雜誌發表文章的說明
2020年1月29日,中國疾病預防控制中心、湖北省疾病預防控制中心等單位有關專業人員共同在新英格蘭雜誌發表了題為《新型冠狀病毒感染的肺炎在中國武漢的初期傳播動力學》的論文,有網友提出質疑。現將有關情況說明如下:
一、論文是根據截至2020年1月23日上報的425例確診病例(包括15名醫務人員)所做的回顧性分析,所有病例在論文撰寫前已向社會公布。論文中提及的15名醫務人員感染病例,分別由國家衛健委高級別專家組組長鐘南山院士於1月20日晚、武漢市衛健委於1月21日凌晨向社會公布。
二、論文提出的「2019年12月份即在密切接觸者中發生了人際傳播」的觀點,是基於425例病例流行病學調查資料做出的回顧性推論。
三、論文是由來自中國疾病預防控制中心、湖北省疾病預防控制中心、香港大學等十幾個單位的專業人員共同完成。
四、及時在學術刊物發表調查結果,有助於國內外專業同行及時了解疾病的特徵,共同評估和研判疫情,改進防控策略。
感謝各位網友的關心和支持,歡迎對我們的工作進行監督。
中國疾病預防控制中心
2020年1月31日
從這篇發表的論文來看,文章確實簡短,不需要太長的撰寫時間。
另外,從事病毒研究的科學家們畢竟也無法直接推動決策部門早採取嚴格措施。
中國疾控中心流行病學首席科學家曾光在接受《環球時報》總編輯胡錫進採訪時表示,武漢此次面對疫情行動有些慢主要是科學認識的問題,但也不排除一些決策上的猶豫,公共衛生人員的決策考慮的就是科學性的問題,是一個科學的視角,但政府官員考慮問題並不單純是科學的視角,這只是他們決策依據的一部分。
當然,這篇論文中也說明了許多重要的問題,注意,所有的結論都是在截止到1月4日的數據上得出的:
1、去年12月已經出現了人傳人現象。
2、測得R0值為2.2,也就是說平均1個病人會傳染給2.2個人。
3、武漢採取了控制措施,其他地方要防止重蹈武漢覆轍。當然,從我們站在1月末的時間點來看,其他地方還遠沒有武漢那麼嚴重。
4、疾病發現早,2天內病人們就會去醫院,但隔離難,發病5天才能住院。
5、醫療工作者這次沒有非典和MERS那麼慘,感染的比例稍低;兒童可能不易感或症狀較輕。
這些問題是怎樣發現的?我們來復盤一下整個研究過程。
如何檢測?
數據來源
最早的病例是由一個叫做「病因不明肺炎」的檢測機制所確定。
它被定義為一種沒有病因病原體的疾病,符合以下標準:
發熱(≥38°C);
肺炎的影像學證據;
白細胞/淋巴細胞計數低;
按照標準臨床指南進行抗菌治療3-5天後沒有症狀改善。
發現肺炎病例後,為了提高早期檢測的靈敏度,於2020年1月3日應用下述病例定義制定了監測方案,從而識別潛在病例。
發現疑似病例後,現場流行病學聯合團隊(由來自中國疾病控制預防中心[中國CDC]以及省、市和縣CDC的成員構成)將收到通知啟動詳細的現場調查,並收集呼吸道標本,之後在位於北京的中國CDC病毒病預防控制所集中檢測。
由中國CDC和當地CDC工作人員構成的聯合團隊對所有2019-nCoV疑似和確診病例進行了詳細的現場調查。
通過對感染者、親屬、密切接觸者和醫務人員進行訪談的方式將數據收集到標準化表格中,收集了有關發病日期、就診日期、住院日期和臨床結局的信息。
研究者對每例感染患者及其親屬(如有必要)進行了訪談,以此來確定發病前2周期內的暴露史,包括暴露於任何野生動物(特別是據稱武漢華南海鮮批發市場出售的動物)的日期、時間、頻率和模式,以及任何相關環境(例如華南海鮮批發市場或其他生鮮市場)的暴露史。
除此之外, 還收集了與其他類似症狀患者接觸的信息。在現場調查期間收集的所有流行病學信息(包括暴露史、事件時間線和密切接觸者的確定)都與多個來源的信息進行了交叉核對。
也對患者發病前2周內曾去過的家庭和地方做了調查。
數據一式兩份錄入中央數據庫,並使用EpiData軟件(EpiData Association)進行核對。
病例定義
對於NCIP疑似病例,目前採用的初步病例定義是基於2003年和2012年世界衛生組織(WHO)建議的SARS和中東呼吸綜合征(MERS)病例定義。
NCIP疑似病例的定義為符合上述全部四條標準的肺炎病例,或者符合前三條標準並且與華南海鮮批發市場有流行病學關聯,或者接觸過其他類似症狀患者的肺炎病例。
2020年1月18日,在獲得關於確診病例的新信息之後,更新了用於定義疑似病例的流行病學標準:
在發病前14天內曾到武漢旅行,或與來自武漢且有發熱或呼吸道症狀的患者直接接觸。
對於確診病例的定義,是在採用下面所述3種方法中的一個,並在呼吸道標本中檢測出2019-nCoV陽性:
分離出2019-nCoV;
實時逆轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)至少有兩次顯示2019-nCoV陽性;
檢測出與2019-nCoV匹配的基因序列。
實驗室檢測
2019-nCoV的實驗室檢查是基於之前WHO的建議。
取患者上、下呼吸道標本。提取RNA,使用2019-nCo特異性引物和探針進行實時RT-PCR檢測。
檢測分別在湖北省CDC和中國CDC病毒病預防控制所的生物安全二級實驗室中進行。
如果兩個靶點經特異性實時RT-PCR檢測呈陽性,則視為實驗室確診。循環閾值(Ct值)<37被定義為陽性,≥40被定義為陰性。中等載量(定義為Ct值為37~<40)需要進行復測確診。如果復測Ct值小於40且觀察到明顯的峰值,或者復測Ct值小於37,則認為復測結果為陽性。
確診患者中位年齡59歲,平均潛伏期5.2天
在新型冠狀病毒疫情發展過程中,病例數量呈指數增長,最近幾天的曲線下降可能是由於近期發病的病例未得到充分確認,以及病例識別和報告時間的延遲,而非發病率的真正拐點。
△ 圖1:武漢市首批425例新型冠狀病毒感染肺炎確診病例的發病情況
具體而言,曲線後半部分並不表示 新髮病例數量減少,而是由於截止日期前的病例確認有所延遲。
大多數最早的病例均報告了華南海鮮批發市場暴露史,但從12月底開始,與該市場不相關的病例數量呈指數增長。
患者的中位年齡為59歲(範圍:15~89歲),425例患者中有240例(56%)為男性。沒有任何病例是15歲以下兒童。
還對三個時間段的病例做了分析:
第一個時間段是1月1日(關閉華南海鮮批發市場的日期)前發病的患者;
第二時間段是1月1日至1月11日(向武漢提供RT-PCR試劑的日期)期間發病的患者;
第三個時間段是1月12日或之後發病的患者。
△ 表1:截至2020年1月22日,武漢市新型冠狀病毒感染肺炎患者特徵分析
發病較早的患者年齡略輕,男性比例較高,報告華南海鮮批發市場暴露史的比例明顯較高。醫務人員在病例中所占的比例在三個時間段逐步增加。
對10例確診病例的暴露數據做了分析,可能平均潛伏期為5.2天(95%置信區間[CI],4.1~7.0);分布情況的第95百分位數為12.5天(95% CI,9.2~18),如圖2.A所示。
△ 圖2:事件發生關鍵時間的分布情況
除此之外,還獲得了5個病例集群的信息,如圖3所示。
根據這些集群中6對病例的發病日期,我們可能由一人傳至另一人的平均(±SD)間隔時間分布情況為7.5±3.4天(95% CI,5.3~19),如圖2.B所示。
在截至2020年1月4日的流行曲線中,傳染病增長率為每天0.10(95% CI,0.050~0.16),倍增時間為7.4天(95% CI,4.2~14)。應用上述由一人傳至另一人的間隔時間分布情況,可能R0為2.2(95% CI,1.4~3.9)。
在1月1日之前發病的45例患者中,從發病至首次就診的平均間隔期可能為5.8天(95% CI,4.3~7.5),與1月1日至1月11日期間發病的207例患者的數據相似,後者的平均間隔期為4.6天(95% CI,4.1~5.1),如圖2.C所示。
在1月1日之前發病的44例患者中,從發病至住院的平均間隔期可能為12.5天(95% CI,10.3到~14.8),這一間隔期超過1月1日至1月11日期間發病的189例患者(均值,9.1天;95% CI,8.6~9.7),如圖2.D。
由於近期發病和發病與就診之間的間隔期較長的患者尚未檢測出來,並未繪制1月12日或之後發病患者的分布曲線。
△ 圖3:5個病例集群(包括16例病例)的詳細暴露信息和發病日期。
數據意味著什麼
根據前面的研究,論文作者們得出了幾條重要的結論。
去年12月已經人傳人
有證據表明自2019年12月中以來在親密接觸者之間已經發生了人與人之間的傳播,之後的一個月,疾病逐漸傳播擴散。
根據截止到1月4日的數據,武漢市大約每7.4天,肺炎病例的數量就增加一倍。
因此在武漢之外的其他城市,需要做出很大的努力來減少傳播,防止新型冠狀病毒肺炎大範圍爆發,必須在有危險的人群中採取預防或減少傳播的措施。
平均1個病人會傳染給2.2個人
借助截至1月4日的數據,研究者們判斷,這場疾病的R0值約為2.2。
R0值,也就是平均每個病人會把疾病傳染給幾個人,或者說平均一個肺炎病患會把疾病傳染給2.2個人。
而只要R0值大於1,一種疾病就會蔓延起來,疾病的預防和控制,就是把R0降到1以下。SARS的R0值大概是3,後來靠隔離患者和小心謹慎的感染控制,SARS被控制住了。
而控制新興冠狀病毒肺炎的難點就在於需要隔離輕度感染者,而用於隔離病患和和親密接觸者的資源有限。
由於數據只到1月4日,之後武漢的人們的防疫意識增強、防控舉措升級,傳染能力有所下降。
但其他地區和其他國家病例依然在增加,疾病依然在蔓延。因此,研究者們建議,現在需要明確其他地方是否會重蹈武漢覆轍,避免發生和武漢一樣強度的本地傳播。
疾病發現早,難隔離
從這些數據看來,病人從發病都就醫之間的間隔通常很短,27%的患者在出現發熱症狀2天內就去醫院就診了。
但是,等待住院的時間非常長,89%的患者要等發病第5天才能住院。
這些數據意味著,早期的患者難以識別、難以隔離,必須在門診和急診投入大量資源進行檢測,主動發現病例,這是遏制局部擴散的重要策略。
醫療工作者沒非典那麼慘,兒童可能不易感
早期的病例中,兒童患者相對較少,425例病例幾乎有一半是60歲以上患者,兒童可能不太容易被感染,或者即使感染了,症狀也比較輕。
而在醫療工作者方面,被感染的比例沒有SARS和MERS爆發時那麼高。
除此之外,因為疫情早期的數據不夠全面,人們的認識也不足,因此調查可能有局限性。
最後,為了幫助大家完整的判斷疫情和研究進展,我們把 顏寧教授參與的《返樸》團隊整理的時間節點回溯圖搬運如下:
大家可以判斷一下研究的時間線和過程。
論文傳送門
Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia
鏈接:https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001316
— 完 —
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>CDC回應「不管疫情先寫論文」:12月人傳人是基於數據反推,論文是向社會公布信息後才寫的