中國學者最新Cell發文：繪制人肺腺癌的完整蛋白質組圖譜

這項研究提供了對LUAD的新見解，超越了當前的基因組見解。蛋白質組學數據集可作為寶貴而強大的資源，用於加速將基礎研究轉化為臨床實踐更精確的診斷和治療方法。

來自中國科學院上海藥物研究所，國家蛋白質科學中心（北京），國家癌症中心，中國醫學科學院等處的中國科學家團隊最近報告了一項針對103名中國肺腺癌（LUAD）患者的綜合蛋白質組學分析，這一疾病是全球所有癌症類型中的主要致死死因。

這一發現公布在7月9日的Cell雜誌上。研究揭示了與LUAD相幹的分子特征，與臨床結果的關聯，潛在的預後生物標誌物和藥物靶標等。

盡管近年來LUAD的基因組研究在精準醫學領域取得了顯著進展，但仍有很大一部分LUAD患者仍缺乏針對性的治療策略。由於蛋白質是生物活動的直接執行者，因此對LUAD的蛋白質組學研究可以填補基因組異常與致癌蛋白質功能之間的知識鴻溝。

為了全面了解LUAD的分子結構，並為更準確地診斷和治療LUAD提供幫助，在這項研究中，科學家們對103位LUAD患者的腫瘤組織，及其配對的非癌性相鄰組織進行了蛋白質組和磷酸化蛋白質組分析。他們總共鑒定出11,119個蛋白質和22,564個磷酸化位點。將這些蛋白質組學數據與臨床資訊和基因組學數據相結合，可獲得LUAD的全面分子圖譜。

從中研究人員發現，上皮-間質轉化以及炎症和致癌信號通路可能導致了I期LUAD的不良預後。他們進一步確定了中國LUAD患者的兩個主要驅動基因——EGFR或TP53突變的患者的遺傳變異與蛋白質組學特征之間的聯繫。

EGFR突變患者中觀察到兩種組織學標誌物：TTF-1和Napsin-A，以及剪接體中蛋白質的表達水平升高。TP53突變的患者中，包括DNA復制和錯配修復在內的幾種致癌門路發生了顯著變化。

值得注意的是，研究人員將所有患者分為三種蛋白質組學亞型（S-I，S-II，S-III），每種亞型均具有獨特的分子特征和臨床特征。

全面的生物資訊學分析表明，S-1患者與細胞環境和良好的預後相幹。相比之下，S-III患者與細胞增殖和蛋白質組穩定性以及預後不良有關。磷酸蛋白質組學分析進一步揭示了不同蛋白質組學亞型中激活的信號通路和激酶。

蛋白質組學數據和臨床數據的綜合分析進一步揭示了27種潛在的血漿生物標誌物和LUAD的幾種藥物靶標。HSP90β是潛在的生物標誌物之一，已在獨立隊列中開始進一步驗證。

這項研究提供了對LUAD的新見解，超越了當前的基因組見解。蛋白質組學數據集可作為寶貴而強大的資源，用於加速將基礎研究轉化為臨床實踐更精確的診斷和治療方法。